DNA存储搜索引擎GeneFind上线：在万亿碱基对中毫秒级检索目标数据

微软研究院在9月5日发布了与基因测序公司Illumina联合开发的DNA存储搜索引擎GeneFind。这个系统解决了DNA数据存储技术面临的最大实际瓶颈：如何在数万亿碱基对中快速找到并读取目标数据片段。

DNA数据存储的密度极高（1克DNA可存储215PB数据），但其检索速度一直是商业化的主要障碍。传统方法需要对整个DNA池进行全量测序才能找到目标数据，耗时从数小时到数天不等。

GeneFind引入了一种名为「分子索引」的技术方案。在数据写入DNA时，系统会为每个数据块附加一段独特的索引序列。检索时，GeneFind使用CRISPR-Cas系统作为「分子搜索引擎」——它携带与目标索引序列互补的引导RNA，在DNA池中精准定位并切割目标片段，随后通过纳米孔测序仪快速读取。

在基准测试中，GeneFind在包含10万亿碱基对的DNA存储池中实现了平均3.2毫秒的检索延迟，比传统全量测序方法快了约1000万倍。Illumina首席技术官表示：「GeneFind让DNA存储从冷归档技术变成了热存储技术。」