蛋白质从头设计引擎ProteinForge深度：AI用氨基酸序列编写全新的生命分子

从理解蛋白质到创造蛋白质

AlphaFold解决了蛋白质结构预测问题，但这只是理解生命的上半场。下半场——从零设计自然界不存在的蛋白质——正在被一家名为ProteinDesign的创业公司推进到全新的阶段。2029年1月，该公司发布了ProteinForge蛋白质从头设计引擎，将设计成功率从此前的5%提升至40%。

ProteinForge的核心是一个在10亿个已知蛋白质结构和功能数据上训练的生成式AI模型。与此前的蛋白质设计工具不同，ProteinForge不是从目标结构反推序列，而是直接从功能需求出发生成序列。用户输入所需的功能描述（如「在60度高温下催化酯化反应」），ProteinForge会生成数十个候选序列，并预测每个序列的折叠结构、稳定性和功能强度。

在实验室验证中，ProteinForge设计的100个酶候选中有41个成功表达并展现出预期功能。其中一种用于塑料降解的酶，在60度条件下的催化效率是天然PETase酶的8倍。另一种用于生物燃料生产的纤维素酶，将秸秆转化为可发酵糖的效率提高了3倍。

ProteinDesign已与诺华和巴斯夫达成合作，将ProteinForge应用于新药靶点发现和工业酶开发。公司的估值在最新一轮融资中达到12亿美元。